127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0926 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0926  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  100 
 
 		 259 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  96.91 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4405  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  96.53 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4530  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  95.75 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.490677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4690  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  84.62 
 
 		 260 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.222111  normal  0.0239811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13080  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  81.85 
 
 		 259 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57540  putative cytochrome c1 precursor  83.46 
 
 		 260 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0905  cytochrome c1-like protein  80.31 
 
 		 259 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5001  putative cytochrome c1 precursor  83.85 
 
 		 260 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3699  cytochrome c1  52.9 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.201159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2660  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome C1  51.92 
 
 		 245 aa  259  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0667489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004507  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase cytochrome C1 subunit  49.81 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2468  cytochrome c1  50.19 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0366705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00885  ubiquinol-cytochrome c reductase  51.91 
 
 		 245 aa  254  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2872  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  49.03 
 
 		 243 aa  254  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0293144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0610  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  49.81 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3019  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  49.62 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0107  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  49.06 
 
 		 245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00110393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3305  cytochrome c1  48.46 
 
 		 244 aa  251  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3199  cytochrome c1  49.03 
 
 		 231 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.663491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0604  cytochrome c1  49.62 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000593  normal  0.0809473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3426  cytochrome c1  49.62 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0003058  normal  0.104383 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0603  cytochrome c1  49.23 
 
 		 232 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0224721  hitchhiker  0.00000571786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3534  cytochrome c1  49.03 
 
 		 231 aa  248  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000922213  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0751  cytochrome c1  47.94 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0945236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0564  cytochrome c1  47.49 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000336048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3704  cytochrome c1  47.49 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00197574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0572  cytochrome c1  48.28 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834423  normal  0.355949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3761  cytochrome c1  48.08 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000196164  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3887  cytochrome c1  48.08 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3274  cytochrome c1  47.69 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0283583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  46.74 
 
 		 747 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4164  cytochrome c1  47.51 
 
 		 233 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0116839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0803  cytochrome c1  47.89 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000755074  hitchhiker  0.00778647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0297  cytochrome c1  43.85 
 
 		 240 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1831  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c1 subunit  42.69 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2217  cytochrome c1  42.22 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00439  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  48.68 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.288886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2927  putative cytochrome C1 precursor transmembrane protein  43.08 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0811  cytochrome c1  43.07 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000393598  hitchhiker  0.0000113285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2857  cytochrome c1  43.08 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.453799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3204  cytochrome c1  42.31 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4438  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  46.44 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.581473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3228  cytochrome c1  41.67 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2696  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3673  cytochrome c1 precursor  40.91 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.276349  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3258  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1807  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.216061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3648  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3705  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 252 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2746  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.91 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1404  cytochrome c1  43.62 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0137  cytochrome c1  40.93 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.148946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0416  putative cytochrome C1 transmembrane protein  41.57 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2975  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.53 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.674351  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3542  cytochrome c1  40.78 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608845  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0127  cytochrome c1  40.93 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0525293  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2741  cytochrome c1  39.16 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2664  cytochrome c1  39.77 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0443  cytochrome c1  39.77 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0422  cytochrome c1  39.77 
 
 		 252 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674989  hitchhiker  0.0000052369 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2631  hypothetical protein  42.39 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0346  cytochrome c1  39.77 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2758  hypothetical protein  41.98 
 
 		 248 aa  198  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1003  cytochrome c1  42.47 
 
 		 245 aa  198  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0835319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1363  cytochrome c1  42.08 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3541  cytochrome c1  38.64 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1960  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  41.41 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3091  cytochrome c1  40.23 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0370  cytochrome c1  41.2 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0361  cytochrome c1  40.77 
 
 		 252 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1943  ubiquinol cytochrome C oxidoreductase, cytochrome C1 subunit  41.03 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.810872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2966  cytochrome c1  40 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1878  cytochrome c1  40.6 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0851  cytochrome c1 precursor  39.68 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.815731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3694  cytochrome c1  37.74 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5501  cytochrome c1  37.13 
 
 		 251 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1422  ubiquinol cytochrome c1 reductase  40.79 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00068249  normal  0.213297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1585  cytochrome c1  41.23 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1140  cytochrome c1  39.06 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0717268  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0791  cytochrome c1  37.74 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.174357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0754  cytochrome c1  37.36 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3933  cytochrome c1  37.65 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0794  cytochrome c1  40 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0108816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0715  cytochrome c1  37.36 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2209  cytochrome c1  35.47 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.198534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2107  cytochrome c1  32.82 
 
 		 242 aa  165  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0932  cytochrome c1  41.6 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1202  cytochrome c1  40.59 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0823  cytochrome c1  36.06 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.862192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2353  cytochrome c1  38.81 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.922589  hitchhiker  0.000000000801731 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2731  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  38.81 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0309003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0993  cytochrome c1  33.08 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.697791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3111  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1 subunit  33.78 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2709  cytochrome c1  33.78 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000107976  unclonable  0.0000000000354845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03201  putative ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome c1  40.65 
 
 		 107 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000484188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0356  cytochrome c1  23.67 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000188446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0156  cytochrome c1  24.32 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.221677 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  23.67 
 
 		 688 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  21.11 
 
 		 688 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>