More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1493 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1493  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  36.76 
 
 		 342 aa  118  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.18 
 
 		 328 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.18 
 
 		 328 aa  102  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  31.28 
 
 		 342 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.83 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  26.64 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1990  alanine racemase  30.9 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 340 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.66 
 
 		 335 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.48 
 
 		 338 aa  97.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.91 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  29.35 
 
 		 334 aa  96.7  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.05 
 
 		 353 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.88 
 
 		 335 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  27.75 
 
 		 340 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 330 aa  95.1  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 323 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 336 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 323 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.53 
 
 		 323 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.02 
 
 		 323 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  28.35 
 
 		 323 aa  92.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  27.98 
 
 		 323 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 336 aa  92  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  27.98 
 
 		 323 aa  92  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 329 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 342 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  28.85 
 
 		 337 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.02 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 348 aa  90.5  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  28.26 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.92 
 
 		 323 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0604  LacI family transcription regulator  29.82 
 
 		 325 aa  89.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00243454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.55 
 
 		 336 aa  89.7  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 341 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 379 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1983  transcriptional regulator, LacI family  30.67 
 
 		 345 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  27.19 
 
 		 340 aa  88.2  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 331 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  30.35 
 
 		 339 aa  87.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  28.85 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  28.85 
 
 		 343 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 339 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  25.93 
 
 		 346 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  25.68 
 
 		 354 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  26.58 
 
 		 353 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0300  transcriptional regulator, LacI family  28.85 
 
 		 339 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 341 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  28.37 
 
 		 343 aa  86.3  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 330 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  26.98 
 
 		 370 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 331 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  29.95 
 
 		 339 aa  85.9  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.77 
 
 		 336 aa  85.5  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1032  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 376 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  28.97 
 
 		 333 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 338 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  27.32 
 
 		 357 aa  85.1  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0779  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.32 
 
 		 342 aa  85.1  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.561354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  27.59 
 
 		 332 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 337 aa  84.7  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.33 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  32.18 
 
 		 689 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  30.6 
 
 		 338 aa  84.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  23.89 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0271  transcriptional regulator, LacI family  27.88 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  34.24 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2808  LacI family transcription regulator  30.2 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0294888  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  27.7 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2376  LacI family transcription regulator  28.02 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0719999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  30.4 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1752  diguanylate cyclase  31.5 
 
 		 718 aa  84  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.972307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0533  LacI family transcription regulator  30.5 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.985534  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  27.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  27.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  27.23 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25.22 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  27.23 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  26.11 
 
 		 340 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  28.05 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  29.9 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  27.35 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0974  putative sugar-binding protein  29.96 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  26.92 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5093  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  26.75 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  28.32 
 
 		 336 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  28.43 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 336 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.47 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  25.65 
 
 		 340 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 340 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>