253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2814 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2814  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 118 aa  242  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.742637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  43.97 
 
 		 120 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 119 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  43.97 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  36.61 
 
 		 114 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2023  endoribonuclease L-PSP family protein  35.4 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1309  endoribonuclease L-PSP family protein  35.4 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.264768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1494  endoribonuclease L-PSP family protein  35.4 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1966  endoribonuclease L-PSP family protein  35.4 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1962  endoribonuclease L-PSP family protein  35.4 
 
 		 114 aa  90.5  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 115 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  35.4 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  38.39 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  38.39 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 118 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  38.6 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  36.28 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  36.84 
 
 		 118 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  36.94 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  36.28 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  36.28 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 116 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  36.75 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  39.13 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  33.91 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  33.04 
 
 		 117 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.39 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  32.74 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  36.61 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  29.82 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  33.04 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  31.25 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  34.51 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2015  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>