More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2297 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 113 aa  231  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  76.58 
 
 		 113 aa  176  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  63.39 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  62.5 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  61.06 
 
 		 117 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  61.95 
 
 		 115 aa  136  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  61.17 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  59.29 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  59.82 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 118 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 117 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  60.18 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  58.77 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  61.54 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  59.29 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  58.04 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  58.41 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 116 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  58.93 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  57.27 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  57.89 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  55.86 
 
 		 116 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  56.36 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  57.14 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  56.36 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  58.04 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 121 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  55.45 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  56.03 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  54.05 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  54.05 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  53.91 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  52.99 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  47.75 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  110  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  49.56 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3301  endoribonuclease L-PSP  80 
 
 		 69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719751  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  52.68 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  50.43 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 120 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  51.79 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  50.89 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  51.75 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  51.75 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  50.89 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  50.89 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  50.89 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  52.83 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  49.04 
 
 		 106 aa  103  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  50 
 
 		 117 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 114 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  50 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  50.94 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  49.06 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 116 aa  100  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 114 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>