More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06343 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  248  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  73.33 
 
 		 120 aa  196  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  65.79 
 
 		 119 aa  160  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  65.79 
 
 		 115 aa  157  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  42.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 115 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  38.6 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 131 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  41.74 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  41.74 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  39.47 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  39.47 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.87 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  40.35 
 
 		 118 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  40.87 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  41.96 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 117 aa  94.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  40.87 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  41.23 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 118 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  41.23 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  34.19 
 
 		 118 aa  92  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  40.68 
 
 		 119 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 117 aa  91.7  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  42.74 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  35.71 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  36.84 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  41.88 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2814  Endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.742637  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 114 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 116 aa  85.5  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 114 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  39.82 
 
 		 113 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1962  endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2023  endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1309  endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.264768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1966  endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1494  endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  37.17 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>