291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2814 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2814  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 115 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  67.54 
 
 		 119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  64.91 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  65.79 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 114 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  37.72 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.97 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1962  endoribonuclease L-PSP family protein  39.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2023  endoribonuclease L-PSP family protein  39.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1494  endoribonuclease L-PSP family protein  39.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1966  endoribonuclease L-PSP family protein  39.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1309  endoribonuclease L-PSP family protein  39.47 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.264768  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2814  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 118 aa  92  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.742637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 117 aa  91.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  47.67 
 
 		 116 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 116 aa  91.3  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 116 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 116 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  38.6 
 
 		 114 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  35.65 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 117 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 118 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  37.93 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  37.72 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2015  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 116 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  36.52 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  37.07 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  35.34 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  36.61 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  37.82 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  40.35 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  35.34 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  37.07 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  35.34 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  35.34 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  35.34 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  39.47 
 
 		 116 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>