More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1379 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2023  endoribonuclease L-PSP family protein  92.98 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.201612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1966  endoribonuclease L-PSP family protein  92.98 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1309  endoribonuclease L-PSP family protein  92.98 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.264768  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1962  endoribonuclease L-PSP family protein  92.98 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1494  endoribonuclease L-PSP family protein  92.98 
 
 		 114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  87.72 
 
 		 114 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  71.05 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  72.81 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  72.81 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  72.81 
 
 		 114 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2227  Endoribonuclease L-PSP  70.18 
 
 		 114 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.39224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  71.93 
 
 		 114 aa  170  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  70.18 
 
 		 114 aa  170  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2015  Endoribonuclease L-PSP  68.42 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  54.95 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  45.22 
 
 		 118 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 118 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  50.88 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  50.88 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  48.28 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  43.86 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  49.55 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  45.22 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  45.61 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.1 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 113 aa  99.8  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  43.97 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  43.97 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 114 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  45.13 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 116 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  42.98 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  44.64 
 
 		 115 aa  94.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  42.02 
 
 		 119 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  41.74 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  41.38 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 117 aa  90.5  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 119 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  40.35 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  45.54 
 
 		 113 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2203  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 119 aa  90.5  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000019478 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 117 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  43.48 
 
 		 116 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>