273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2329 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2329  YceI family protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.664269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  31.58 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  32.08 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  33.5 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  32.99 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 217 aa  94.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  29.36 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  33.33 
 
 		 216 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  35.59 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  32.58 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  32.58 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  33.33 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  32.46 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.32 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  32.02 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  30.11 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  37.59 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  33.33 
 
 		 207 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.37 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  31.43 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  28.64 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  31.79 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  38.52 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33.33 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.09 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  30.39 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  34.96 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  30.22 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  27.1 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  32.02 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  31.46 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  29.94 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  35.38 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  28.33 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  33.33 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  29.94 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  32.08 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  31.66 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  31.82 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  30.06 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  31.61 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1385  YceI like family protein  29.17 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00309571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  28.33 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  28 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  28 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  30.23 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  28.73 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  29.94 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4488  YceI family protein  27.7 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.644863  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.64 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  26.78 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  27.75 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  30.33 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  26.7 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  29.89 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  27.91 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  30.51 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  26.7 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  26.77 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  31.11 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  27.78 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  29.78 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  27.94 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.17 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  26.97 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  27.22 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  28.91 
 
 		 191 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  26.97 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  29.22 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  30.05 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  30.53 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0016  YceI-like family protein  31.16 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  27.21 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  30.05 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  25.42 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  26.43 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1185  YceI like family protein  31.16 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1156  hypothetical protein  31.16 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  26.11 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0144  hypothetical protein  31.16 
 
 		 328 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0826223  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0423  YceI like family protein  31.16 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.31148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  28.35 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  29.68 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  28.49 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  31.69 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  25.54 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  28.49 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  28.49 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1415  hypothetical protein  32.17 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264366  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1502  YceI like family protein  32.17 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263508  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0268  hypothetical protein  29.79 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.92 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  25.47 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  28.25 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  24.58 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>