157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0836 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2976  protein of unknown function DUF72  38.63 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.206183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1217  hypothetical protein  38.37 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.766238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1445  protein of unknown function DUF72  35.74 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1433  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0905  hypothetical protein  33.2 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0967  hypothetical protein  30.71 
 
 		 236 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1889  hypothetical protein  32.65 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1426  hypothetical protein  32.65 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0009  hypothetical protein  29.15 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  23.94 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  27.86 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  27.27 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  27.9 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  25.98 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  28.29 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.12 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  29.44 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  22.27 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  26.39 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  36.89 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0418  hypothetical protein  25.68 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.443516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  39.81 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  26.73 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  28.17 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  28.17 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  32.05 
 
 		 241 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  45.16 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3451  hypothetical protein  56.52 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  43.75 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  50.98 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  48.21 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  48.21 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0753  protein of unknown function DUF72  48.84 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  24.9 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  43.75 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  37.14 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  35.16 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1928  protein of unknown function DUF72  26.83 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0869752  normal  0.0349575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  40 
 
 		 303 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2472  hypothetical protein  27.69 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  41.27 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  27.27 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0312  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.835667  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  28.63 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  29.32 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5493  hypothetical protein  33.64 
 
 		 321 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.0343585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  32.99 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  28.12 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  36.49 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  27.07 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  39.39 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  28.27 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0238  protein of unknown function DUF72  34.95 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000268215  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  30.43 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  25.7 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  32.48 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1271  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 		 284 aa  50.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000066434  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  27.15 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  38.1 
 
 		 340 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  40.91 
 
 		 282 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  26.64 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  55 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  28.82 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  35.82 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3592  hypothetical protein  46.94 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2949  hypothetical protein  27.56 
 
 		 300 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5900  hypothetical protein  42.42 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2879  hypothetical protein  23.39 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  23.27 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  29.2 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  24.56 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  40.82 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  41.51 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  47.62 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  29.15 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  43.75 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4505  hypothetical protein  31.01 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.15421  normal  0.57305 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  41.67 
 
 		 308 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  36.92 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  31.62 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  31.73 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4589  hypothetical protein  31.48 
 
 		 300 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1478  protein of unknown function DUF72  37.88 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.864912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0190  hypothetical protein  35.62 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.665614  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  42.86 
 
 		 277 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  43.48 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  46.51 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  20.65 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3896  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  43.48 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  40 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  39.53 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  39.53 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  34.85 
 
 		 252 aa  45.4  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>