183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2472 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2472  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  471  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2879  hypothetical protein  51.34 
 
 
227 aa  264  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  52.65 
 
 
229 aa  226  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  52.7 
 
 
231 aa  226  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  50.9 
 
 
231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  52.25 
 
 
231 aa  210  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  43.86 
 
 
231 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  42.42 
 
 
240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  37.61 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0418  hypothetical protein  41.44 
 
 
217 aa  161  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.443516  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  32.23 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  30.93 
 
 
293 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  33.19 
 
 
242 aa  95.1  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  26.34 
 
 
242 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  26.58 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  26.75 
 
 
247 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  31.84 
 
 
264 aa  86.3  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  27.8 
 
 
261 aa  85.9  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.51 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1426  hypothetical protein  28.34 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  34.69 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  34.69 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  29.06 
 
 
267 aa  82  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  34.69 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  30.7 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.89 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  32.89 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  32.44 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  28.03 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0967  hypothetical protein  27.39 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  28.07 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.62 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  32.61 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  29.33 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  28.07 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  32.38 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  30.91 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  27.89 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  25.1 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1411  hypothetical protein  28.74 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  29.25 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1889  hypothetical protein  27.13 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  29.39 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  33.63 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.35 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.17 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  26.87 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  31.25 
 
 
303 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  28.51 
 
 
308 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  27.27 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  32.17 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  27.93 
 
 
325 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  28.63 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  32.79 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  27.98 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0905  hypothetical protein  24.4 
 
 
239 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  28.76 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  26.92 
 
 
313 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  24.27 
 
 
291 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  27.31 
 
 
387 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  31.14 
 
 
246 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  28.79 
 
 
277 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  30.17 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3824  protein of unknown function DUF72  29.88 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  26.03 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6330  protein of unknown function DUF72  25.35 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  30.62 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  26.14 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  25.83 
 
 
295 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  30.82 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  26.64 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  27.91 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  30.56 
 
 
244 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  31.94 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  25.19 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0654  protein of unknown function DUF72  28.93 
 
 
286 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1087  hypothetical protein  30.88 
 
 
275 aa  56.2  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  26 
 
 
286 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2383  hypothetical protein  27.49 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0169242  normal  0.0347484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0369  hypothetical protein  27.95 
 
 
256 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  24.74 
 
 
350 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  27.78 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9014  hypothetical protein  26.05 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.19539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0209  hypothetical protein  24.81 
 
 
282 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  28.12 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0836  hypothetical protein  27.69 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.280501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  31.09 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  29.79 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0902  protein of unknown function DUF72  27 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125228  normal  0.753863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  24.68 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  26.09 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  25.18 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  25.44 
 
 
321 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  29.53 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  24.73 
 
 
281 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>