159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2879 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2879  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  473  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2472  hypothetical protein  51.34 
 
 
230 aa  264  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0205  hypothetical protein  48.91 
 
 
229 aa  236  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.967531 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2017  hypothetical protein  47.37 
 
 
231 aa  226  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1859  hypothetical protein  47.19 
 
 
231 aa  222  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.868685  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1134  hypothetical protein  43.97 
 
 
231 aa  210  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.324615 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1263  hypothetical protein  44.59 
 
 
231 aa  207  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0418  hypothetical protein  42.11 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.443516  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0131  hypothetical protein  44.44 
 
 
240 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1082  protein of unknown function DUF72  38.96 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00357332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0421  protein of unknown function DUF72  33.91 
 
 
267 aa  92  6e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.738835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1062  hypothetical protein  26.22 
 
 
248 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  28.94 
 
 
243 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5551  protein of unknown function DUF72  28.25 
 
 
261 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108654 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5461  protein of unknown function DUF72  28.33 
 
 
293 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.208371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1156  protein of unknown function DUF72  28.7 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.692068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  26.72 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0720  hypothetical protein  31.47 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  28.06 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  27.97 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  27.04 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  28.76 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  31.39 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2839  hypothetical protein  23.85 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  25.22 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  25.99 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  28.88 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  28.81 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  25 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  27.56 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  25.32 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  25.32 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10243  hypothetical protein  27.38 
 
 
291 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  28.51 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  26.96 
 
 
350 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  27.43 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2992  hypothetical protein  28.69 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0078078  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0138  hypothetical protein  28.63 
 
 
387 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  26.59 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  25.68 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  24.47 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0078  protein of unknown function DUF72  26.38 
 
 
241 aa  62.4  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3363  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0778  hypothetical protein  28.35 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  26.1 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  25.94 
 
 
305 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3305  protein of unknown function DUF72  25.54 
 
 
299 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  29.86 
 
 
244 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1426  hypothetical protein  25 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255562  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  26.7 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4724  protein of unknown function DUF72  26.11 
 
 
303 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  hitchhiker  0.00165415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  29.86 
 
 
246 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  23.53 
 
 
313 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0315  protein of unknown function DUF72  28.68 
 
 
266 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2967  hypothetical protein  26.44 
 
 
241 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1896  hypothetical protein  23.77 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  26.32 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3016  hypothetical protein  29.73 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628542  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0508  hypothetical protein  24.71 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  28.17 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  26.5 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3019  hypothetical protein  28.36 
 
 
298 aa  56.6  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  23.64 
 
 
242 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1160  hypothetical protein  24.4 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6252  hypothetical protein  27.91 
 
 
283 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1295  hypothetical protein  24.4 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1153  hypothetical protein  25.52 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0787  protein of unknown function DUF72  23.45 
 
 
279 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.778077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  28.14 
 
 
305 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3289  hypothetical protein  31.2 
 
 
283 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  26.26 
 
 
308 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  23.51 
 
 
312 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  24.47 
 
 
286 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0268  hypothetical protein  24.11 
 
 
286 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  26.16 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  27.15 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  26.16 
 
 
303 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1217  hypothetical protein  22.87 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.766238  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  26.16 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  25.11 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  25.11 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  26.91 
 
 
242 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4101  hypothetical protein  24.17 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4140  hypothetical protein  29.39 
 
 
296 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950206  hitchhiker  0.001504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2952  protein of unknown function DUF72  25.22 
 
 
241 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3482  hypothetical protein  27.61 
 
 
317 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  25.94 
 
 
336 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  25.94 
 
 
322 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1898  hypothetical protein  25.6 
 
 
274 aa  52  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.652332  normal  0.220603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0235  hypothetical protein  23.68 
 
 
271 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  23.42 
 
 
312 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3605  hypothetical protein  27.61 
 
 
317 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053.2  hypothetical protein  26.32 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0967  hypothetical protein  22.89 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1194  hypothetical protein  26.36 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0081  hypothetical protein  30.77 
 
 
275 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>