More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1568 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1568  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 339 aa  665    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1309  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.93 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0203  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.39 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0139093  normal  0.0653049 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0401  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.39 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.496763 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  61.7 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.18 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.36 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.59 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  37.82 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.24 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.53 
 
 		 338 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.12 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  40.29 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.5 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.26 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.26 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.47 
 
 		 331 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.08 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.71 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.79 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.48 
 
 		 339 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.65 
 
 		 341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.84 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.65 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.47 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.48 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.79 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.46 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.55 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.04 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.55 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.92 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.4 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.21 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.48 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.48 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.52 
 
 		 347 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.61 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.95 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.3 
 
 		 338 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.68 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.41 
 
 		 334 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.3 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.01 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.95 
 
 		 340 aa  208  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.92 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.19 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.9 
 
 		 367 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.97 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.07 
 
 		 345 aa  206  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.72 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.87 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.65 
 
 		 350 aa  204  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.26 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.39 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  37.36 
 
 		 348 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.24 
 
 		 340 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.28 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.02 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.86 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.6 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.42 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.32 
 
 		 345 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.54 
 
 		 341 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.81 
 
 		 347 aa  199  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.01 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.57 
 
 		 367 aa  199  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.65 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.63 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.32 
 
 		 352 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.34 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.86 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.39 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.57 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.07 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  37.61 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.32 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.48 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.47 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.83 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.67 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.07 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.21 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.07 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.03 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  34.99 
 
 		 348 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.03 
 
 		 324 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.07 
 
 		 336 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.66 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.72 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.07 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.89 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.73 
 
 		 324 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.92 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.03 
 
 		 335 aa  188  9e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.26 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  34.31 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>