More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0935 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
331 aa  656    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  73.41 
 
 
331 aa  488  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.21 
 
 
331 aa  481  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  67.07 
 
 
331 aa  455  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  62.5 
 
 
341 aa  408  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.66 
 
 
334 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.96 
 
 
334 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.96 
 
 
334 aa  348  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.38 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  49.13 
 
 
347 aa  332  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 
334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.43 
 
 
352 aa  310  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.26 
 
 
339 aa  310  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.36 
 
 
341 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 
341 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 
341 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.5 
 
 
340 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.25 
 
 
365 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 
330 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 
337 aa  285  8e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  46.06 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 
340 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.11 
 
 
347 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.4 
 
 
344 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.71 
 
 
349 aa  276  3e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.12 
 
 
366 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 
352 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.61 
 
 
347 aa  275  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.78 
 
 
345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.79 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  44.48 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 
336 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 
337 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 
336 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 
348 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.81 
 
 
367 aa  271  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 
335 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.05 
 
 
341 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 
345 aa  270  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  43.58 
 
 
346 aa  269  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 
345 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 
352 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.92 
 
 
348 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.21 
 
 
348 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 
351 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.53 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 
354 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  44.41 
 
 
356 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.02 
 
 
347 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.62 
 
 
330 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.59 
 
 
348 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.59 
 
 
348 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 
348 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 
350 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
352 aa  262  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 
349 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1309  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.22 
 
 
346 aa  261  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19082  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 
368 aa  260  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
349 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.28 
 
 
336 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 
367 aa  258  8e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.58 
 
 
336 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 
337 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.06 
 
 
340 aa  257  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 
355 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 
355 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 
355 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 
348 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 
338 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 
336 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.3 
 
 
334 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.46 
 
 
359 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
335 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.59 
 
 
341 aa  256  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.33 
 
 
373 aa  256  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.26 
 
 
338 aa  255  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.3 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.09 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.65 
 
 
340 aa  253  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 
336 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.7 
 
 
334 aa  252  6e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.41 
 
 
342 aa  252  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 
336 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.71 
 
 
342 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 
336 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
342 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 
325 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 
335 aa  250  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 
354 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.11 
 
 
341 aa  249  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.65 
 
 
335 aa  249  4e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>