More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1077 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 336 aa  677    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  66.57 
 
 		 333 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  67.16 
 
 		 341 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.88 
 
 		 340 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.68 
 
 		 341 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  67.87 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.31 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 352 aa  358  8e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  51.21 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.91 
 
 		 335 aa  354  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.01 
 
 		 341 aa  351  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.61 
 
 		 351 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.99 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.06 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  345  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.48 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.12 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  50.3 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.2 
 
 		 367 aa  335  5e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 347 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.25 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.05 
 
 		 336 aa  333  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.52 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.82 
 
 		 348 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  51.06 
 
 		 351 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 		 337 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  51.75 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.35 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.5 
 
 		 349 aa  325  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.76 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.78 
 
 		 370 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.36 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.35 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 334 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 348 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 348 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.85 
 
 		 345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 339 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 339 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.18 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.28 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.94 
 
 		 338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 354 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 		 341 aa  308  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.94 
 
 		 338 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.95 
 
 		 353 aa  308  9e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.02 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.34 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.88 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.04 
 
 		 338 aa  305  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.13 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.8 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.56 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.19 
 
 		 334 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.38 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.13 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.37 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.89 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 355 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 355 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 355 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  48.5 
 
 		 446 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.69 
 
 		 359 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  48.24 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>