279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2404 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 359 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.31 
 
 		 355 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.31 
 
 		 355 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.31 
 
 		 355 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  84.21 
 
 		 373 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.8 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.59 
 
 		 359 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.94 
 
 		 352 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  61.78 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.93 
 
 		 336 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.83 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1069  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.62 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.582687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.61 
 
 		 347 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.32 
 
 		 347 aa  348  7e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.77 
 
 		 351 aa  346  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.31 
 
 		 352 aa  346  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 345 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 347 aa  344  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.61 
 
 		 349 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.98 
 
 		 336 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.23 
 
 		 350 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.38 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 345 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  54.23 
 
 		 348 aa  332  6e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  50 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 341 aa  328  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  52.42 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.19 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.64 
 
 		 330 aa  326  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 		 347 aa  325  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.7 
 
 		 367 aa  324  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.84 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.44 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.66 
 
 		 367 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.47 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.69 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 337 aa  318  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.24 
 
 		 336 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.7 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.73 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.61 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.41 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.8 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 348 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 340 aa  311  7.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.12 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.99 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.82 
 
 		 348 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  50.15 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.57 
 
 		 351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.72 
 
 		 349 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  51.87 
 
 		 351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.48 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 333 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.89 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  51.8 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.63 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.14 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.78 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 341 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 352 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.22 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  50.74 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.4 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.44 
 
 		 340 aa  292  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.83 
 
 		 325 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.58 
 
 		 351 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.27 
 
 		 437 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 331 aa  290  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.82 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.92 
 
 		 325 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.83 
 
 		 338 aa  288  7e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.19 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1799  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.22 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0201119 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.89 
 
 		 341 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.24 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.87 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.59 
 
 		 353 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 		 335 aa  282  6.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.41 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.41 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>