More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1953 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 336 aa  660    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  76.79 
 
 		 336 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  76.26 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  75.89 
 
 		 336 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  75.96 
 
 		 349 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.81 
 
 		 337 aa  484  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  66.47 
 
 		 336 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.63 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  55.36 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.06 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.76 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.82 
 
 		 352 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.84 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.93 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.51 
 
 		 344 aa  343  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.76 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.27 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.08 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.2 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.21 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 348 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.9 
 
 		 350 aa  330  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  52.42 
 
 		 346 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 367 aa  328  7e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.47 
 
 		 330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.34 
 
 		 341 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.27 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.8 
 
 		 344 aa  325  6e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 336 aa  325  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.44 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.12 
 
 		 330 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 349 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.41 
 
 		 354 aa  324  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.99 
 
 		 341 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.06 
 
 		 349 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.42 
 
 		 349 aa  322  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.94 
 
 		 348 aa  320  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 347 aa  319  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.15 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.29 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.63 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 340 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 351 aa  311  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.03 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.73 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.54 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.9 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.25 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.62 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.46 
 
 		 345 aa  306  3e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.4 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.4 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 340 aa  306  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.4 
 
 		 355 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 352 aa  302  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.83 
 
 		 341 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 		 338 aa  301  7.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.47 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  47.48 
 
 		 356 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 349 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  51.05 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  50.89 
 
 		 446 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.25 
 
 		 372 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.24 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 355 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.01 
 
 		 370 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.48 
 
 		 437 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.43 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.82 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.82 
 
 		 342 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.4 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 336 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 337 aa  278  7e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>