257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0090 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 333 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.33 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  52.42 
 
 		 335 aa  351  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.03 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.25 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.24 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.8 
 
 		 338 aa  320  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.43 
 
 		 349 aa  321  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 		 366 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.81 
 
 		 335 aa  315  7e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.32 
 
 		 368 aa  311  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.62 
 
 		 367 aa  310  2e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  45.15 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.15 
 
 		 330 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.31 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.08 
 
 		 351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.76 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  44.94 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.32 
 
 		 352 aa  301  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.55 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.97 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.37 
 
 		 336 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 		 344 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.71 
 
 		 352 aa  298  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 		 345 aa  298  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.55 
 
 		 348 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 336 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.67 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 		 347 aa  295  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.94 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 		 337 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.06 
 
 		 340 aa  292  6e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.4 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  44.51 
 
 		 356 aa  289  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.24 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.63 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.14 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.17 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 342 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.4 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 370 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.32 
 
 		 370 aa  286  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.51 
 
 		 345 aa  285  5.999999999999999e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 		 355 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 340 aa  285  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.05 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 336 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 		 354 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  45.67 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.27 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 342 aa  282  5.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  43.84 
 
 		 351 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.92 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.92 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.45 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 		 353 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.67 
 
 		 372 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.31 
 
 		 341 aa  276  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.88 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  44.22 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.99 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 		 336 aa  271  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.58 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.54 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.28 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 		 341 aa  268  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>