More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2277 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 341 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  78.01 
 
 		 341 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  73.9 
 
 		 340 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.12 
 
 		 333 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.68 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  66.37 
 
 		 334 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.36 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.43 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.25 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  55.13 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.26 
 
 		 341 aa  358  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.69 
 
 		 336 aa  348  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.19 
 
 		 337 aa  348  8e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.06 
 
 		 330 aa  345  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.81 
 
 		 336 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.63 
 
 		 349 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  55.1 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.37 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.33 
 
 		 348 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.03 
 
 		 351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.22 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.92 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.91 
 
 		 366 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.44 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.03 
 
 		 341 aa  330  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  52.98 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.79 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.01 
 
 		 367 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.05 
 
 		 337 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 348 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.41 
 
 		 354 aa  328  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.03 
 
 		 347 aa  328  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.76 
 
 		 367 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.34 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.06 
 
 		 337 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 345 aa  325  6e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  54.01 
 
 		 351 aa  322  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.65 
 
 		 349 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.55 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.53 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 348 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.78 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.36 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.03 
 
 		 338 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.46 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.96 
 
 		 352 aa  315  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.77 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.79 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.49 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.46 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.06 
 
 		 355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.5 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.2 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.68 
 
 		 334 aa  305  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.05 
 
 		 355 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  52.65 
 
 		 446 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.85 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 344 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.16 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 348 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.1 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.13 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.46 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.46 
 
 		 352 aa  299  4e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  51.03 
 
 		 356 aa  299  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 351 aa  298  7e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.58 
 
 		 337 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.84 
 
 		 336 aa  297  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.84 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 336 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.55 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.55 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.84 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.55 
 
 		 336 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 339 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.58 
 
 		 342 aa  295  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.03 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.71 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.99 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 		 339 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.71 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 		 335 aa  288  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.54 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>