More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2811 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  100 
 
 
351 aa  700    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  84.18 
 
 
354 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  78.51 
 
 
351 aa  555  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  84.66 
 
 
370 aa  548  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  74.36 
 
 
349 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.42 
 
 
348 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.76 
 
 
348 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.18 
 
 
348 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.47 
 
 
341 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  67.44 
 
 
350 aa  471  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.42 
 
 
349 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.78 
 
 
330 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  66.2 
 
 
354 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  67.15 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.61 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.54 
 
 
353 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.57 
 
 
352 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.53 
 
 
348 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.36 
 
 
336 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.41 
 
 
341 aa  359  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 
367 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 
367 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.24 
 
 
340 aa  348  1e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 
337 aa  347  1e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.25 
 
 
344 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.65 
 
 
336 aa  345  5e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.05 
 
 
341 aa  345  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.52 
 
 
352 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.05 
 
 
352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.18 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.63 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.33 
 
 
333 aa  343  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.1 
 
 
345 aa  342  5e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  55.82 
 
 
446 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.06 
 
 
336 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.5 
 
 
330 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.05 
 
 
366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 
348 aa  339  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.13 
 
 
368 aa  337  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  50 
 
 
335 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.21 
 
 
337 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 
335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.56 
 
 
349 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.01 
 
 
341 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.65 
 
 
372 aa  332  6e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.33 
 
 
340 aa  331  9e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 
347 aa  331  1e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 
345 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.16 
 
 
370 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.18 
 
 
347 aa  329  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  52.21 
 
 
356 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 
337 aa  325  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.85 
 
 
335 aa  325  9e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.53 
 
 
352 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.38 
 
 
340 aa  322  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.55 
 
 
336 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.37 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.16 
 
 
340 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 
334 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.82 
 
 
359 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.65 
 
 
336 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.87 
 
 
340 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.3 
 
 
350 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.97 
 
 
348 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 
348 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.05 
 
 
336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.35 
 
 
334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.01 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.44 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.44 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.44 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.53 
 
 
337 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.12 
 
 
373 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 
355 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 
347 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 
341 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 
344 aa  308  9e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.31 
 
 
351 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.82 
 
 
338 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.75 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.15 
 
 
362 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.86 
 
 
351 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 
338 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 
333 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 
336 aa  300  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 
337 aa  298  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 
342 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.25 
 
 
349 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 
336 aa  295  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
336 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 
336 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  50 
 
 
340 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 
336 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
336 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
336 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
336 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>