247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3902 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 336 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.58 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.43 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 		 347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 336 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 336 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 336 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 367 aa  309  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 345 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.25 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.64 
 
 		 348 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.38 
 
 		 337 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 347 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 		 347 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.95 
 
 		 350 aa  301  8.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.97 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.9 
 
 		 335 aa  298  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.82 
 
 		 351 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 		 352 aa  296  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.81 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  46.61 
 
 		 335 aa  295  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  45.83 
 
 		 446 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 347 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 		 351 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 		 336 aa  292  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.02 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.02 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.65 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 336 aa  291  9e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  43.84 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.49 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.08 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.96 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 367 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 366 aa  288  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.54 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 		 336 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.49 
 
 		 355 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.49 
 
 		 355 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.49 
 
 		 355 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.92 
 
 		 352 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 354 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.09 
 
 		 362 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 348 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 		 339 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.52 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  44.78 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.31 
 
 		 349 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.76 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.55 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.62 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.62 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 		 370 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.49 
 
 		 340 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.11 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.09 
 
 		 335 aa  277  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.55 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.96 
 
 		 355 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.32 
 
 		 339 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 		 338 aa  275  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.62 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.54 
 
 		 370 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  43.36 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.59 
 
 		 340 aa  269  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 353 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.59 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 359 aa  268  8.999999999999999e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 437 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>