More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0788 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 336 aa  667    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.06 
 
 		 324 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.37 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.37 
 
 		 324 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.88 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.3 
 
 		 336 aa  381  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.88 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.66 
 
 		 338 aa  335  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.24 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.91 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.76 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.14 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 		 339 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 		 339 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 338 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 338 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.16 
 
 		 335 aa  308  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 328 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.81 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.59 
 
 		 336 aa  269  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.52 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.37 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  43.44 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.02 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.19 
 
 		 348 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 348 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.88 
 
 		 344 aa  251  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.19 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 		 336 aa  249  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.6 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.12 
 
 		 341 aa  248  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.83 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.74 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.52 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.96 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.54 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.96 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.4 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.53 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  41.09 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.45 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.88 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.77 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.67 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.59 
 
 		 344 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.39 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.66 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.79 
 
 		 345 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.1 
 
 		 347 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.64 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.72 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.04 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 		 336 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.04 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.77 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.44 
 
 		 347 aa  235  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 336 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.89 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 		 340 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  40.3 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.61 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.7 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.66 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.36 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.55 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.39 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.09 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.65 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 		 336 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.58 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.48 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.23 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  38.25 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.94 
 
 		 342 aa  231  9e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>