More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3013 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 325 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  73.23 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  49.1 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 335 aa  320  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.35 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.94 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.59 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.02 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.63 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.08 
 
 		 367 aa  309  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  47.2 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.85 
 
 		 337 aa  303  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.61 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.59 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.56 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.42 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.69 
 
 		 347 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.42 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.67 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.73 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.81 
 
 		 339 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.35 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 352 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.81 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 352 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.99 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.18 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.42 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 368 aa  298  7e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.81 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.32 
 
 		 345 aa  298  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.43 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.02 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.5 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.5 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.29 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.88 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 340 aa  296  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.97 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.81 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.88 
 
 		 338 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.62 
 
 		 355 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.89 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  46.88 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.2 
 
 		 338 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  46.25 
 
 		 446 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 345 aa  285  8e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.54 
 
 		 344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 		 341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 349 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 335 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.94 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.29 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.4 
 
 		 340 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.25 
 
 		 373 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.29 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.51 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.45 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.61 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  47.32 
 
 		 340 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.65 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.76 
 
 		 336 aa  276  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 		 347 aa  276  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.18 
 
 		 355 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  44.44 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.64 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.08 
 
 		 354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.88 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.84 
 
 		 336 aa  272  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.55 
 
 		 349 aa  271  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 		 349 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.54 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.25 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.62 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>