284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1093 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
333 aa  668    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.21 
 
 
334 aa  298  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.82 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.82 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.34 
 
 
335 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.85 
 
 
336 aa  286  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 
336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.56 
 
 
338 aa  282  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 
337 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.12 
 
 
338 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 
348 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 
325 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.41 
 
 
355 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.05 
 
 
338 aa  275  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.76 
 
 
351 aa  275  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.15 
 
 
338 aa  275  9e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.88 
 
 
325 aa  272  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 
349 aa  270  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.78 
 
 
333 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
335 aa  269  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 
336 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.28 
 
 
328 aa  268  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 
341 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 
332 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.17 
 
 
349 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 
334 aa  267  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 
366 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.55 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.43 
 
 
367 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 
350 aa  265  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 
338 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.95 
 
 
350 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 
337 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.43 
 
 
351 aa  265  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  41.21 
 
 
346 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 
338 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 
338 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 
336 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00353  Hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
350 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
338 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 
348 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 
352 aa  262  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.55 
 
 
352 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.82 
 
 
345 aa  262  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  44.51 
 
 
335 aa  261  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 
330 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.44 
 
 
336 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
338 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 
352 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.52 
 
 
340 aa  259  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
347 aa  259  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.9 
 
 
335 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.56 
 
 
339 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.15 
 
 
339 aa  258  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.03 
 
 
352 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.74 
 
 
341 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  41.12 
 
 
348 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.27 
 
 
348 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.56 
 
 
339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.56 
 
 
339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.3 
 
 
348 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.23 
 
 
340 aa  256  3e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 
354 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.28 
 
 
354 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.12 
 
 
370 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  42.22 
 
 
356 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.39 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 
368 aa  253  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
324 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  41.82 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.12 
 
 
337 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.77 
 
 
336 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.07 
 
 
336 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
342 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  41.82 
 
 
340 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.12 
 
 
340 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.64 
 
 
367 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
342 aa  250  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
342 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.12 
 
 
340 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.47 
 
 
333 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.94 
 
 
341 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.96 
 
 
334 aa  249  5e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.46 
 
 
344 aa  249  6e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.53 
 
 
336 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.54 
 
 
347 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.88 
 
 
355 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.88 
 
 
355 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.88 
 
 
355 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.12 
 
 
342 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 
370 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.454857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>