More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1281 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 370 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  84.66 
 
 		 351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.33 
 
 		 354 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.32 
 
 		 351 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  74.15 
 
 		 349 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.75 
 
 		 354 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  69.36 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.54 
 
 		 348 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.97 
 
 		 348 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.79 
 
 		 348 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  69.36 
 
 		 346 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.04 
 
 		 330 aa  478  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  67.81 
 
 		 350 aa  481  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.64 
 
 		 341 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.8 
 
 		 353 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.83 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.46 
 
 		 352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.14 
 
 		 348 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.86 
 
 		 336 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.5 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.82 
 
 		 367 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.25 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.65 
 
 		 341 aa  363  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.26 
 
 		 368 aa  362  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.6 
 
 		 337 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.68 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  55.49 
 
 		 348 aa  359  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.09 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.76 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.03 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.62 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.25 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.35 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.27 
 
 		 352 aa  355  6.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.55 
 
 		 340 aa  355  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.25 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.42 
 
 		 352 aa  353  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.08 
 
 		 372 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  52.37 
 
 		 335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.94 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.24 
 
 		 345 aa  349  4e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  57.52 
 
 		 446 aa  347  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.51 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.24 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.1 
 
 		 340 aa  346  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.05 
 
 		 345 aa  346  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.3 
 
 		 341 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 349 aa  342  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.8 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  53.37 
 
 		 356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.55 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.99 
 
 		 349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.49 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.19 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.94 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.3 
 
 		 355 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.6 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.06 
 
 		 370 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.3 
 
 		 336 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.82 
 
 		 337 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.38 
 
 		 354 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.63 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.96 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.29 
 
 		 347 aa  328  6e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.42 
 
 		 334 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.51 
 
 		 340 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.71 
 
 		 336 aa  327  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.22 
 
 		 340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.86 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.86 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.85 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.21 
 
 		 334 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.91 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.04 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.03 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.72 
 
 		 351 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.38 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.24 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.51 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.93 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  51.74 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.43 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.34 
 
 		 349 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.4 
 
 		 373 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.7 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.7 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.7 
 
 		 355 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.44 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.17 
 
 		 337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.63 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.63 
 
 		 352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 336 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>