More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3795 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  90.62 
 
 		 352 aa  640    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 352 aa  692    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.84 
 
 		 349 aa  489  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.51 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.51 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.51 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  65.8 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.93 
 
 		 373 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.74 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.55 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.23 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.14 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.94 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.3 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.57 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.55 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.64 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.23 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.22 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.94 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.3 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.8 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.33 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.45 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.06 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.33 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1069  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.89 
 
 		 353 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.582687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  53.73 
 
 		 335 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.1 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.63 
 
 		 341 aa  359  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.27 
 
 		 330 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.71 
 
 		 348 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  56.14 
 
 		 348 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.5 
 
 		 336 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.84 
 
 		 351 aa  353  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.43 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.46 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.2 
 
 		 347 aa  350  3e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.93 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 336 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.08 
 
 		 351 aa  348  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.19 
 
 		 349 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.42 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.52 
 
 		 340 aa  344  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.17 
 
 		 368 aa  342  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.81 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.86 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.05 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.71 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  51.82 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.31 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.61 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.66 
 
 		 330 aa  332  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.78 
 
 		 354 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.64 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  51.62 
 
 		 356 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.75 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.54 
 
 		 348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.6 
 
 		 370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 341 aa  327  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.01 
 
 		 333 aa  326  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.06 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  54.52 
 
 		 351 aa  325  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.23 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.83 
 
 		 366 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.93 
 
 		 340 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.42 
 
 		 370 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.55 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  53.29 
 
 		 446 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 		 335 aa  319  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.82 
 
 		 362 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.64 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 		 355 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 337 aa  316  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.51 
 
 		 372 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.52 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.08 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.71 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.45 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.47 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  51.61 
 
 		 340 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.19 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.32 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 340 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 352 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 349 aa  294  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1799  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.1 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0201119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.55 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>