283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1799 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1799  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
343 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0201119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.91 
 
 
348 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.04 
 
 
348 aa  361  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.04 
 
 
348 aa  361  9e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.55 
 
 
351 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.01 
 
 
350 aa  338  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.31 
 
 
337 aa  316  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.23 
 
 
349 aa  311  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.1 
 
 
352 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.62 
 
 
367 aa  305  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 
344 aa  305  9.000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.38 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.1 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.94 
 
 
341 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 
352 aa  298  6e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.95 
 
 
344 aa  298  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.24 
 
 
330 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 
354 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.43 
 
 
350 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 
367 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.06 
 
 
347 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.38 
 
 
373 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.67 
 
 
347 aa  291  8e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.8 
 
 
355 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.8 
 
 
355 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.8 
 
 
355 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 
336 aa  291  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 
348 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 
352 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 
351 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.69 
 
 
349 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 
345 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.32 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.19 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.83 
 
 
344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.34 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  44.71 
 
 
335 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.15 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 
336 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.2 
 
 
340 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.2 
 
 
340 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.71 
 
 
335 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  48.96 
 
 
340 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 
341 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 
348 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 
335 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  46.59 
 
 
356 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.28 
 
 
347 aa  279  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.39 
 
 
330 aa  279  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.02 
 
 
340 aa  278  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.08 
 
 
336 aa  279  7e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 
366 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.95 
 
 
348 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.93 
 
 
359 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 
338 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  44.28 
 
 
346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.73 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.25 
 
 
355 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 
335 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 
348 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.52 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.73 
 
 
352 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.03 
 
 
334 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 
339 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 
348 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.54 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
336 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.78 
 
 
351 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.58 
 
 
325 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.09 
 
 
359 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 
336 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.17 
 
 
362 aa  265  7e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 
368 aa  265  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 
370 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 
336 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.33 
 
 
349 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.38 
 
 
356 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.92 
 
 
336 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 
338 aa  263  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 
338 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 
338 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 
338 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.21 
 
 
334 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.91 
 
 
338 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.21 
 
 
339 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.63 
 
 
370 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.58 
 
 
339 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  45.81 
 
 
351 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 
337 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 
340 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1069  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.26 
 
 
353 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.582687  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.28 
 
 
339 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 
338 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.51 
 
 
354 aa  257  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 
336 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>