276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2040 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 335 aa  686    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.58 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.58 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.84 
 
 		 334 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.38 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.38 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.19 
 
 		 338 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.4 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.28 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.98 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.68 
 
 		 338 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.08 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.68 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.78 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.98 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.69 
 
 		 338 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.29 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.25 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.27 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 336 aa  319  5e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.27 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.16 
 
 		 336 aa  308  8e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 		 340 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 347 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.67 
 
 		 367 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 324 aa  297  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.56 
 
 		 368 aa  296  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 		 324 aa  295  5e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.28 
 
 		 345 aa  296  5e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  44.58 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 347 aa  295  7e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 		 347 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.11 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.81 
 
 		 348 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 		 347 aa  292  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 348 aa  291  8e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.76 
 
 		 366 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.63 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.63 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.63 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.63 
 
 		 336 aa  288  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.75 
 
 		 341 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.33 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.33 
 
 		 336 aa  288  9e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.98 
 
 		 335 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 		 337 aa  286  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.33 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  44.97 
 
 		 348 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.75 
 
 		 336 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.98 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.59 
 
 		 342 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.28 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.87 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.92 
 
 		 334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  44.25 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.43 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 336 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 325 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 		 342 aa  281  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  46.93 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 336 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  46.93 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.04 
 
 		 336 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 352 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.14 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.34 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.39 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.35 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.58 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.84 
 
 		 352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.94 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1799  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0201119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 350 aa  262  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.59 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.59 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.59 
 
 		 355 aa  260  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.95 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.44 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>