232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0881 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 390 aa  785    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.15 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.15 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.71 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.78 
 
 		 338 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.78 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.41 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.92 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 338 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 338 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.9 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.07 
 
 		 324 aa  331  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.73 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 		 334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.17 
 
 		 334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  56.14 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.27 
 
 		 335 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.71 
 
 		 338 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.17 
 
 		 332 aa  319  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 336 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.45 
 
 		 339 aa  315  9e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.76 
 
 		 339 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.76 
 
 		 339 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.76 
 
 		 339 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.67 
 
 		 351 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.84 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  43.96 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.9 
 
 		 367 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.31 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.65 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.83 
 
 		 337 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.43 
 
 		 367 aa  282  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.21 
 
 		 348 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.52 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.52 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.62 
 
 		 342 aa  279  7e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.16 
 
 		 347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.91 
 
 		 342 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.76 
 
 		 437 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.74 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.9 
 
 		 325 aa  270  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.71 
 
 		 355 aa  269  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.68 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.8 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.4 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  40.71 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 325 aa  266  7e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.74 
 
 		 344 aa  265  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  47.4 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.97 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.95 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 340 aa  262  6.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 337 aa  262  8.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.85 
 
 		 336 aa  262  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.55 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.15 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.83 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.49 
 
 		 340 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.94 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.58 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.98 
 
 		 336 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 		 340 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  256  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.62 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.62 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.57 
 
 		 349 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.14 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.14 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.14 
 
 		 355 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  49.13 
 
 		 340 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.43 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.83 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.61 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.97 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.69 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.4 
 
 		 340 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.13 
 
 		 336 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  38.05 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.02 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.52 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.64 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.4 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.17 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.95 
 
 		 348 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  45.86 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  45.86 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.99 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.24 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.08 
 
 		 333 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>