More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3982 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  98.14 
 
 		 322 aa  639    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.21 
 
 		 336 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.21 
 
 		 336 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.21 
 
 		 336 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 336 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.51 
 
 		 336 aa  669    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  99.11 
 
 		 336 aa  670    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  98.14 
 
 		 322 aa  639    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.81 
 
 		 336 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  92.26 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  92.26 
 
 		 336 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  91.96 
 
 		 336 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  91.67 
 
 		 336 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  91.37 
 
 		 336 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.04 
 
 		 336 aa  577  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.54 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.24 
 
 		 342 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.33 
 
 		 337 aa  491  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.4 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.3 
 
 		 367 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 367 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.73 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  55.75 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  53.12 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.73 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 344 aa  325  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 345 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 347 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  50.15 
 
 		 346 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.51 
 
 		 352 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 350 aa  318  9e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 347 aa  315  8e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 347 aa  315  9e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 340 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.42 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 		 345 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  51.78 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  47.18 
 
 		 335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.44 
 
 		 351 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.48 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.07 
 
 		 340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.07 
 
 		 340 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.55 
 
 		 370 aa  301  9e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.84 
 
 		 341 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 336 aa  292  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 		 338 aa  291  8e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.18 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.45 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.63 
 
 		 335 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.21 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.82 
 
 		 349 aa  288  7e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.08 
 
 		 340 aa  287  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.06 
 
 		 330 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  48.82 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.76 
 
 		 338 aa  286  4e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.31 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.9 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.24 
 
 		 338 aa  285  9e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.63 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.02 
 
 		 372 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.02 
 
 		 338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.02 
 
 		 350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 352 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.35 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  46.75 
 
 		 351 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.06 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.52 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.35 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.52 
 
 		 334 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.61 
 
 		 337 aa  279  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.76 
 
 		 338 aa  278  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 349 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 339 aa  278  8e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.59 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>