265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2024 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 338 aa  693    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  78.81 
 
 		 339 aa  547  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.34 
 
 		 336 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  78.7 
 
 		 338 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  75.74 
 
 		 338 aa  544  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.76 
 
 		 339 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.76 
 
 		 339 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.76 
 
 		 339 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.76 
 
 		 338 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.15 
 
 		 338 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.46 
 
 		 338 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.15 
 
 		 338 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  75.45 
 
 		 335 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.17 
 
 		 334 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  61.03 
 
 		 332 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  61.45 
 
 		 334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.69 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.87 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.87 
 
 		 330 aa  358  5e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.19 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.78 
 
 		 390 aa  339  4e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.66 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 367 aa  332  5e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.76 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 324 aa  318  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  50.14 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 324 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 		 324 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.76 
 
 		 347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 333 aa  311  9e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.63 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.19 
 
 		 345 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 368 aa  309  5e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.25 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.51 
 
 		 345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.59 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.88 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.59 
 
 		 325 aa  306  3e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.2 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.48 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.75 
 
 		 348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 342 aa  301  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 342 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.9 
 
 		 348 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.47 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  47.77 
 
 		 356 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.78 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  47.58 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.69 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 		 347 aa  292  4e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.7 
 
 		 337 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 344 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 350 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  48.35 
 
 		 340 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 336 aa  289  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 		 336 aa  288  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.8 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  48.19 
 
 		 446 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 355 aa  286  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.29 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.53 
 
 		 355 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 		 336 aa  282  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.29 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.5 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.49 
 
 		 341 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.65 
 
 		 340 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.65 
 
 		 340 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.86 
 
 		 352 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.88 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.48 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.49 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.77 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.65 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.41 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.76 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.15 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 340 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>