262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3203 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
336 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.63 
 
 
336 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.63 
 
 
336 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.93 
 
 
336 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.63 
 
 
336 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.63 
 
 
336 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.12 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.33 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.12 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  85.42 
 
 
336 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  83.04 
 
 
336 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  84.23 
 
 
336 aa  567  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  84.52 
 
 
336 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  84.47 
 
 
322 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  84.47 
 
 
322 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.87 
 
 
342 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  69.25 
 
 
337 aa  474  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.77 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.57 
 
 
366 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.25 
 
 
367 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.25 
 
 
368 aa  349  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.18 
 
 
367 aa  349  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  55.03 
 
 
348 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  53.41 
 
 
356 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.79 
 
 
354 aa  332  7.000000000000001e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.57 
 
 
355 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 
337 aa  320  3e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 
345 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 
345 aa  315  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 
348 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 
341 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 
347 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  48.52 
 
 
335 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 
344 aa  311  9e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.52 
 
 
335 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 
347 aa  310  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 
336 aa  308  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.34 
 
 
352 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  48.66 
 
 
346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 
354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 
370 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.26 
 
 
350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 
335 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 
338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 
335 aa  301  9e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 
340 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 
347 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.59 
 
 
348 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  51.48 
 
 
340 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 
344 aa  298  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.48 
 
 
352 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 
330 aa  298  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 
352 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.79 
 
 
340 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 
352 aa  297  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.79 
 
 
340 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 
341 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 
347 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 
349 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.32 
 
 
349 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 
351 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.07 
 
 
336 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 
348 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.59 
 
 
348 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 
334 aa  292  6e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 
339 aa  292  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 
338 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.55 
 
 
330 aa  291  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.75 
 
 
338 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.93 
 
 
351 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 
338 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.83 
 
 
340 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.96 
 
 
338 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.45 
 
 
338 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 
339 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 
339 aa  289  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.76 
 
 
341 aa  288  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 
339 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.76 
 
 
338 aa  288  9e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.45 
 
 
338 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.2 
 
 
333 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 
352 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.75 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  48.37 
 
 
351 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 
337 aa  285  5e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.02 
 
 
355 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 
336 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.52 
 
 
352 aa  285  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.92 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.98 
 
 
341 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.32 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.69 
 
 
370 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.01 
 
 
349 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.73 
 
 
372 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>