More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3750 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 355 aa  696    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  82.3 
 
 		 356 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  69.75 
 
 		 354 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.96 
 
 		 366 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.52 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.93 
 
 		 367 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.45 
 
 		 340 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  66.17 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.15 
 
 		 340 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.94 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  66.96 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  61.9 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  63.2 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.32 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.86 
 
 		 351 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.6 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.6 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.6 
 
 		 337 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.52 
 
 		 342 aa  349  5e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.36 
 
 		 342 aa  346  4e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.81 
 
 		 370 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.9 
 
 		 349 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  52.08 
 
 		 335 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.46 
 
 		 336 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  342  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  341  9e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  341  9e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  341  9e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.46 
 
 		 350 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.68 
 
 		 345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.01 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  52.82 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.79 
 
 		 336 aa  336  5e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.57 
 
 		 336 aa  335  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.68 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.49 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.8 
 
 		 340 aa  333  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.6 
 
 		 345 aa  332  4e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.68 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.23 
 
 		 348 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 352 aa  331  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.71 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.14 
 
 		 347 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.17 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.88 
 
 		 336 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.19 
 
 		 345 aa  328  7e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.82 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.87 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  53.85 
 
 		 322 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.16 
 
 		 372 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  53.85 
 
 		 322 aa  326  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.98 
 
 		 351 aa  325  7e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 337 aa  323  3e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.98 
 
 		 354 aa  322  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.8 
 
 		 340 aa  322  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.85 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.23 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.08 
 
 		 333 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.71 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.84 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.41 
 
 		 348 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 348 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.06 
 
 		 341 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.59 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.11 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  52.37 
 
 		 351 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.48 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.85 
 
 		 354 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.63 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.81 
 
 		 347 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  53.25 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 337 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.82 
 
 		 349 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.88 
 
 		 325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 338 aa  302  6.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 340 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.46 
 
 		 373 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.66 
 
 		 336 aa  298  8e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.85 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.46 
 
 		 341 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 336 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.4 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>