More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0655 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
324 aa  633  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  99.38 
 
 
324 aa  628  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  98.15 
 
 
324 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  70.37 
 
 
336 aa  457  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.73 
 
 
330 aa  388  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  59.52 
 
 
330 aa  381  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  60.12 
 
 
336 aa  376  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.41 
 
 
390 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.27 
 
 
332 aa  332  5e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.96 
 
 
334 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.9 
 
 
336 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 
338 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.3 
 
 
338 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.8 
 
 
335 aa  315  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.7 
 
 
338 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 
339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 
339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 
338 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 
338 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.1 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 
335 aa  297  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.95 
 
 
334 aa  296  3e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.56 
 
 
328 aa  291  8e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.14 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.11 
 
 
336 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 
333 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 
333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.42 
 
 
350 aa  252  8.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.54 
 
 
367 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 
367 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 
342 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.41 
 
 
341 aa  249  6e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.12 
 
 
366 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.53 
 
 
368 aa  247  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 
348 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 
340 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.6 
 
 
334 aa  245  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.52 
 
 
345 aa  245  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.99 
 
 
345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 
336 aa  243  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 
342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 
351 aa  242  7e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
350 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.22 
 
 
348 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.22 
 
 
348 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 
336 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.34 
 
 
330 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 
336 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.35 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.07 
 
 
325 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.22 
 
 
336 aa  239  5e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 
336 aa  238  6.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  40.79 
 
 
335 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 
347 aa  238  8e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.06 
 
 
336 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.39 
 
 
335 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.51 
 
 
344 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 
347 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.06 
 
 
336 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.06 
 
 
336 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 
341 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 
337 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.57 
 
 
344 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.94 
 
 
340 aa  236  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.41 
 
 
352 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.72 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.16 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.19 
 
 
355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  38.76 
 
 
348 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.72 
 
 
347 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.46 
 
 
348 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.59 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.59 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.82 
 
 
336 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 
336 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 
336 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.05 
 
 
348 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 
336 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.87 
 
 
335 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 
340 aa  229  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 
341 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
330 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 
333 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.54 
 
 
352 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.44 
 
 
337 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.34 
 
 
341 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.64 
 
 
349 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 
344 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.28 
 
 
354 aa  222  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.99 
 
 
340 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.99 
 
 
340 aa  222  7e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.29 
 
 
348 aa  222  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  39.88 
 
 
356 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.34 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.43 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>