More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3400 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 362 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.72 
 
 		 349 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.94 
 
 		 349 aa  346  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.83 
 
 		 352 aa  345  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.56 
 
 		 347 aa  340  2e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.48 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.11 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.97 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.6 
 
 		 348 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  52 
 
 		 349 aa  336  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  51.87 
 
 		 346 aa  335  7.999999999999999e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.09 
 
 		 350 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.48 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.48 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.48 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.85 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.39 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.87 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.08 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.06 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.31 
 
 		 349 aa  325  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.39 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.43 
 
 		 336 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.03 
 
 		 333 aa  323  4e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.29 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.48 
 
 		 354 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.73 
 
 		 344 aa  322  9.000000000000001e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.75 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.23 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.92 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.59 
 
 		 351 aa  318  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  51.15 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 352 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.32 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.59 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.8 
 
 		 356 aa  315  7e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.43 
 
 		 336 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.86 
 
 		 341 aa  315  8e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.87 
 
 		 336 aa  315  9e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.89 
 
 		 347 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.29 
 
 		 337 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.99 
 
 		 345 aa  312  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  47.84 
 
 		 335 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.03 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.67 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.82 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.55 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  49 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  51.87 
 
 		 348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.99 
 
 		 336 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 336 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.45 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  52.46 
 
 		 446 aa  305  7e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  58.69 
 
 		 370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.14 
 
 		 349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.44 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.44 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.19 
 
 		 367 aa  302  7.000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.14 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.59 
 
 		 366 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 348 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.29 
 
 		 351 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.23 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.23 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.29 
 
 		 340 aa  298  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  48.6 
 
 		 356 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.61 
 
 		 368 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.03 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.69 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 372 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.87 
 
 		 337 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  52.12 
 
 		 340 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3926  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.91 
 
 		 353 aa  291  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0716  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.66 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  50 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0864  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.66 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1069  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.43 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.582687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.54 
 
 		 349 aa  289  4e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.43 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.46 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.89 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.46 
 
 		 340 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.01 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.98 
 
 		 437 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.99 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.55 
 
 		 355 aa  286  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 		 336 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.59 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.66 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.88 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.31 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.06 
 
 		 338 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.1 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1799  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.45 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0201119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.44 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.97 
 
 		 331 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.32 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 335 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>