More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3071 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
342 aa  688    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 
342 aa  688    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  99.12 
 
 
342 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6175  hydrogenase expression/formation protein HypE  57.74 
 
 
342 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0950087 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7271  hydrogenase expression/formation protein HypE  55.99 
 
 
341 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0520113  normal  0.413244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 
330 aa  325  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.31 
 
 
337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 
344 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  46.29 
 
 
335 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.71 
 
 
349 aa  294  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.53 
 
 
366 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.7 
 
 
345 aa  293  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 
337 aa  293  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.15 
 
 
344 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 
337 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 
347 aa  291  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.37 
 
 
336 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.88 
 
 
347 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.95 
 
 
338 aa  289  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 
335 aa  289  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 
367 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 
336 aa  288  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.39 
 
 
347 aa  288  1e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 
335 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.82 
 
 
336 aa  285  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.61 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.48 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 
367 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 
347 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 
340 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 
336 aa  282  7.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 
333 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 
336 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 
348 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 
348 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.79 
 
 
345 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.37 
 
 
348 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 
348 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.74 
 
 
336 aa  275  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.94 
 
 
349 aa  275  9e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 
336 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  39.58 
 
 
346 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.06 
 
 
354 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 
350 aa  272  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 
345 aa  272  6e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.48 
 
 
348 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.47 
 
 
341 aa  270  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.6 
 
 
337 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  44.02 
 
 
356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.42 
 
 
352 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 
352 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.64 
 
 
341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.88 
 
 
352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 
334 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.88 
 
 
340 aa  265  8.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.35 
 
 
342 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 
325 aa  263  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 
340 aa  263  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.82 
 
 
341 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 
368 aa  262  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.23 
 
 
341 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.65 
 
 
342 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.46 
 
 
349 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.83 
 
 
344 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 
335 aa  259  7e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.92 
 
 
348 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.05 
 
 
348 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.76 
 
 
349 aa  257  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.52 
 
 
355 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.3 
 
 
330 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 
336 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0706315 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.07 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.76 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.47 
 
 
352 aa  253  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.77 
 
 
337 aa  253  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.62 
 
 
349 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.59 
 
 
336 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.74 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 
336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.64 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.48 
 
 
333 aa  250  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  40.46 
 
 
347 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.51 
 
 
336 aa  249  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.96 
 
 
354 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.88 
 
 
336 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 
336 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 
336 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  38.24 
 
 
351 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 
370 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 
336 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 
331 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.71 
 
 
355 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>