More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2333 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 365 aa  712    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.94 
 
 		 341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.35 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  54.35 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  53.75 
 
 		 340 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.2 
 
 		 331 aa  317  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.11 
 
 		 331 aa  316  5e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  50.43 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.25 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 		 334 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.67 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.67 
 
 		 334 aa  288  9e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.27 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.64 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  44.51 
 
 		 347 aa  275  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.35 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.9 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.57 
 
 		 352 aa  262  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.82 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.75 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.66 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 348 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.36 
 
 		 347 aa  255  7e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.48 
 
 		 351 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.99 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.23 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 350 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  41.64 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.65 
 
 		 339 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.44 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 352 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.94 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.22 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.64 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.35 
 
 		 367 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.57 
 
 		 337 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 347 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.84 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 		 336 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.87 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.34 
 
 		 336 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.54 
 
 		 352 aa  242  7e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.18 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  43.28 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.95 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.72 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.23 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.82 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  44.38 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.37 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.71 
 
 		 332 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.02 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.09 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.23 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.57 
 
 		 340 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.54 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  44.54 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.77 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.25 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.79 
 
 		 336 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.77 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.69 
 
 		 340 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.21 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.1 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.47 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.12 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.23 
 
 		 348 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.21 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 338 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.21 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.21 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.12 
 
 		 338 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 335 aa  229  6e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.87 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.58 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 338 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.23 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.83 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.83 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.64 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.06 
 
 		 333 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.46 
 
 		 330 aa  227  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.3 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  40 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>