More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1413 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 331 aa  655    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  77.34 
 
 		 331 aa  525  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  79.15 
 
 		 331 aa  526  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.21 
 
 		 331 aa  494  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  68.75 
 
 		 341 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  50.58 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.37 
 
 		 334 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.37 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  52.07 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.89 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.37 
 
 		 339 aa  316  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.75 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.45 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.15 
 
 		 340 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.7 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  46.57 
 
 		 335 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.4 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.84 
 
 		 352 aa  288  9e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.21 
 
 		 345 aa  286  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.35 
 
 		 365 aa  285  8e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 347 aa  285  9e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.57 
 
 		 345 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.71 
 
 		 347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  46.92 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.97 
 
 		 335 aa  282  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.87 
 
 		 345 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.6 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  45.97 
 
 		 346 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.15 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.46 
 
 		 344 aa  279  4e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.9 
 
 		 340 aa  279  5e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.13 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.13 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.06 
 
 		 354 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.92 
 
 		 352 aa  278  9e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.85 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.71 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.99 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.35 
 
 		 337 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.94 
 
 		 348 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.97 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.69 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.05 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.58 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.99 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.97 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 350 aa  272  7e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.64 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.74 
 
 		 337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.84 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.51 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.96 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.54 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.32 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.8 
 
 		 359 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.79 
 
 		 348 aa  265  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.62 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.34 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.34 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.34 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.29 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 368 aa  262  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.81 
 
 		 336 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.37 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.34 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.11 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  45.99 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  44.67 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.33 
 
 		 349 aa  258  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.55 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 349 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.35 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.45 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  41 
 
 		 367 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.99 
 
 		 354 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.51 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.16 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.01 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.69 
 
 		 334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.01 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  42.43 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.54 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.56 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.44 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.81 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.96 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.67 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.49 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>