More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0364 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  678    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.43 
 
 		 331 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  69.05 
 
 		 331 aa  474  1e-132  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  68.75 
 
 		 331 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  62.5 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  51 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.74 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.03 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.43 
 
 		 339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.83 
 
 		 341 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.54 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  48.25 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.59 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2333  hydrogenase expression/formation protein HypE  50.43 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.12 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  49.56 
 
 		 334 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.48 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  47.49 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.04 
 
 		 345 aa  292  6e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.77 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  43.97 
 
 		 348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.36 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.48 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.72 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.75 
 
 		 336 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.14 
 
 		 352 aa  286  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.77 
 
 		 345 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.67 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.19 
 
 		 344 aa  285  8e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.08 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.72 
 
 		 348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.99 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.16 
 
 		 336 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.51 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.87 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.05 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  45.35 
 
 		 351 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 340 aa  276  5e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.21 
 
 		 347 aa  275  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.53 
 
 		 351 aa  274  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.44 
 
 		 367 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.66 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.43 
 
 		 345 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  45.59 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.75 
 
 		 367 aa  272  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.07 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.35 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.83 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.44 
 
 		 368 aa  271  8.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.29 
 
 		 348 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.27 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.1 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.88 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.12 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.24 
 
 		 338 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.65 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.31 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.08 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.35 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.61 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.86 
 
 		 336 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.38 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.8 
 
 		 370 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.36 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.27 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.55 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.73 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.22 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.53 
 
 		 336 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.36 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.92 
 
 		 337 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.45 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.51 
 
 		 340 aa  255  7e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.29 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.24 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3234  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.12 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.3 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.25 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.53 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.53 
 
 		 342 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  43.19 
 
 		 356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.19 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.19 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.19 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.99 
 
 		 348 aa  251  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.44 
 
 		 359 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>