240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0390 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 335 aa  662    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  51.94 
 
 		 335 aa  326  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.94 
 
 		 335 aa  323  4e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  51.04 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.13 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0090  hydrogenase expression/formation protein HypE  47.34 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.87 
 
 		 338 aa  292  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.18 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.53 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.37 
 
 		 347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.98 
 
 		 347 aa  286  4e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 		 344 aa  285  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.47 
 
 		 347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  46.27 
 
 		 349 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.94 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.47 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.92 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.39 
 
 		 338 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.31 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.49 
 
 		 345 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.22 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.2 
 
 		 367 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  45.37 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.18 
 
 		 336 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.69 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.35 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.73 
 
 		 367 aa  272  7e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.92 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.23 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2048  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.07 
 
 		 347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  42.43 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.3 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1210  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.04 
 
 		 336 aa  268  7e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0706315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.23 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.24 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.47 
 
 		 350 aa  265  5.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.9 
 
 		 336 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.51 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3902  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.67 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.9 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.84 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.98 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1741  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.54 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.94 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.29 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 		 342 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 		 336 aa  259  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3011  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.48 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.72 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.89 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3063  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.48 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0621596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.84 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3047  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.48 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  hitchhiker  0.00562137 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.84 
 
 		 348 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.42 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.23 
 
 		 342 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.47 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2980  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 336 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.43 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3168  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.18 
 
 		 336 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.707243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.32 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.64 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.66 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.4 
 
 		 348 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.18 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  42.26 
 
 		 446 aa  252  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 352 aa  251  9.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.41 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.76 
 
 		 348 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  39.16 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0305  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.74 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.03 
 
 		 331 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.72 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.1 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.61 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.39 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.82 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.55 
 
 		 437 aa  246  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.46 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.46 
 
 		 336 aa  246  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.79 
 
 		 330 aa  245  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.61 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  41.8 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.19 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.32 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  41.8 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.66 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>