More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1309 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1309  hydrogenase expression/formation protein HypE  100 
 
 		 346 aa  675    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0401  hydrogenase expression/formation protein HypE  72.89 
 
 		 366 aa  503  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.496763 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0203  hydrogenase expression/formation protein HypE  71.72 
 
 		 343 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0139093  normal  0.0653049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1568  hydrogenase expression/formation protein HypE  64.93 
 
 		 339 aa  432  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  61.74 
 
 		 353 aa  420  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  44.22 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.35 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.77 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  39.83 
 
 		 347 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0364  hypothetical protein  43.1 
 
 		 341 aa  242  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.38 
 
 		 352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.69 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  43.06 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.26 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.52 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.36 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.46 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0933  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.38 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.900318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.14 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.38 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.17 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.46 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.78 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1642  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.97 
 
 		 338 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.11 
 
 		 334 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.82 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.79 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  39.83 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.06 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.82 
 
 		 334 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.64 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.17 
 
 		 336 aa  223  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.17 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.03 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.02 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.14 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.9 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.69 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.76 
 
 		 362 aa  219  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.57 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.82 
 
 		 347 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2040  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.35 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.57 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.1 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.07 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.19 
 
 		 339 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.21 
 
 		 370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.64 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  42.77 
 
 		 334 aa  215  8e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.53 
 
 		 340 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.93 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.78 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.83 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.03 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.57 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.97 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.93 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.03 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.75 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.41 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.03 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.78 
 
 		 339 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.78 
 
 		 339 aa  212  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.83 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3074  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.28 
 
 		 340 aa  212  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000468886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.29 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.57 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.43 
 
 		 336 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.75 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.18 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  38.7 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  38 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.14 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.54 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.97 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.97 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.02 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.66 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.9 
 
 		 367 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  36.89 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.93 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00353  Hydrogenase expression/formation protein HypE  37.54 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.9 
 
 		 348 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.11 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.68 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.96 
 
 		 342 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  40.69 
 
 		 355 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  38.4 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.57 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1890  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.36 
 
 		 330 aa  202  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.94 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  41.1 
 
 		 390 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3877  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.29 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  39.48 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.5 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0930  hydrogenase expression/formation protein HypE  37.46 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.857823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  36.39 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>