More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01720 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01720  response regulator  100 
 
 
238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2972  response regulator receiver protein  60.33 
 
 
242 aa  262  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.538919  hitchhiker  0.000910386 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1528  response regulator receiver protein  55.6 
 
 
237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.184722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1471  response regulator receiver protein  55.17 
 
 
237 aa  241  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0303937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1007 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.56 
 
 
918 aa  67.4  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.06 
 
 
918 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0671  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.57 
 
 
469 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
1266 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 
916 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.88 
 
 
918 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  27.98 
 
 
905 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  31.94 
 
 
1083 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0684  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.08 
 
 
469 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000150794 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.88 
 
 
918 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.88 
 
 
918 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.88 
 
 
918 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.88 
 
 
918 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.71 
 
 
922 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1173  response regulator receiver protein  38.52 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.6 
 
 
937 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000242189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
917 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.95 
 
 
223 aa  62.4  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1285  response regulator receiver domain-containing protein  35.59 
 
 
129 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0213798  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.46 
 
 
487 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  30.64 
 
 
230 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  22.02 
 
 
732 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  24.02 
 
 
933 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.12 
 
 
918 aa  60.8  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2693  histidine kinase  28.04 
 
 
782 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.145264  normal  0.474998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
1691 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0835  two component system histidine kinase  28.44 
 
 
831 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1478 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  30.23 
 
 
1098 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 
917 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03881  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ZraS: response regulator/sigma54 interaction protein  37.39 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  24.44 
 
 
657 aa  59.3  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03834  hypothetical protein  37.39 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118236  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  24.44 
 
 
657 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5475  transcriptional regulatory protein ZraR  37.39 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4021  transcriptional regulatory protein ZraR  37.39 
 
 
441 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0128092  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3981  response regulator receiver protein  31.06 
 
 
298 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000307852  hitchhiker  0.00111731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3932  response regulator receiver protein  31.06 
 
 
298 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.9 
 
 
919 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  25 
 
 
1442 aa  58.9  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  33.14 
 
 
231 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4507  transcriptional regulatory protein ZraR  35.59 
 
 
441 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0570238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4385  transcriptional regulatory protein ZraR  35.59 
 
 
441 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4581  transcriptional regulatory protein ZraR  35.59 
 
 
441 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.24 
 
 
941 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.52 
 
 
441 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4454  transcriptional regulatory protein ZraR  36.52 
 
 
441 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209341  hitchhiker  0.000519331 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1160  putative sensor protein gacS  28 
 
 
808 aa  57.8  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4497  transcriptional regulatory protein ZraR  36.52 
 
 
441 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000279415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4505  transcriptional regulatory protein ZraR  35.59 
 
 
441 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.11324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.36 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
1002 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 
357 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 
1029 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3542  PAS sensor protein  28.57 
 
 
656 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11869  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  29.39 
 
 
925 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  33.61 
 
 
984 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.54 
 
 
1226 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  29.39 
 
 
925 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4238  transcriptional regulatory protein ZraR  36.52 
 
 
441 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.020936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2758  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
857 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4549  transcriptional regulatory protein ZraR  36.52 
 
 
441 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000369022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1279  two component transcriptional regulator  27.69 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461363  normal  0.257738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2621  two component transcriptional regulator  27.69 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.75303  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  34.75 
 
 
441 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0823  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.05 
 
 
456 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.449732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
923 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
912 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  22.84 
 
 
937 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  23.61 
 
 
910 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1903  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
984 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.19 
 
 
470 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
576 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  26.94 
 
 
917 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 
1074 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2343  response regulator receiver  32.43 
 
 
440 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  25 
 
 
1042 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  25.65 
 
 
968 aa  55.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1876  transmission sensor LetS  23.61 
 
 
910 aa  55.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  29.52 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3465  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
489 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.06 
 
 
451 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.667822  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  29.5 
 
 
1084 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
645 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  31.9 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>