88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4565 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4565    100 
 
 		 357 bp  708    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.87 
 
 		 975 bp  373  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  86.91 
 
 		 981 bp  281  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85.66 
 
 		 969 bp  242  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  85 
 
 		 969 bp  238  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.28 
 
 		 972 bp  220  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.28 
 
 		 972 bp  220  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  83.33 
 
 		 969 bp  198  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  83.19 
 
 		 972 bp  151  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  87.32 
 
 		 960 bp  139  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  80.06 
 
 		 969 bp  127  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0186  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.75 
 
 		 1020 bp  87.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2462    100 
 
 		 633 bp  85.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1018    97.87 
 
 		 186 bp  85.7  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.891485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4766  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  83.8  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  100 
 
 		 1125 bp  81.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1225    100 
 
 		 1869 bp  81.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 1605 bp  81.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.33 
 
 		 1860 bp  65.9  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  94.74 
 
 		 1011 bp  60  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1950  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  92.86 
 
 		 1005 bp  60  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein  90.91 
 
 		 1047 bp  56  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0785342  normal  0.616274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3079  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  100 
 
 		 1005 bp  56  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.41088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3750  dipeptide transporter ATP-binding subunit  83.75 
 
 		 1020 bp  56  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2086  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP- binding protein  89.36 
 
 		 963 bp  54  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1863  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  90.7 
 
 		 996 bp  54  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.515218  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  86.44 
 
 		 1620 bp  54  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  90.7 
 
 		 1584 bp  54  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3819  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  92.11 
 
 		 1011 bp  52  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3036  dipeptide transporter ATP-binding subunit  92.11 
 
 		 1017 bp  52  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.195523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  92.11 
 
 		 1659 bp  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5135  peptide ABC transporter, ATP binding protein, oppD-like protein  89.13 
 
 		 999 bp  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0719  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, ATP-binding protein  96.67 
 
 		 1827 bp  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  88 
 
 		 1836 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2852  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 972 bp  50.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0931  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.55 
 
 		 1035 bp  50.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.275633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  88.89 
 
 		 1659 bp  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5776  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  90.24 
 
 		 915 bp  50.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  83.56 
 
 		 1020 bp  50.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  85.96 
 
 		 999 bp  50.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0209  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 996 bp  50.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.065739  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0032  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.94 
 
 		 1041 bp  50.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  100 
 
 		 927 bp  50.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0635  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.79 
 
 		 1080 bp  50.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.712616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0186  ABC transporter related  100 
 
 		 2124 bp  50.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  100 
 
 		 1758 bp  48.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  93.75 
 
 		 726 bp  48.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  96.43 
 
 		 453 bp  48.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  88.64 
 
 		 1860 bp  48.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2910  dipeptide transporter ATP-binding subunit  82.5 
 
 		 1038 bp  48.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  88.64 
 
 		 1893 bp  48.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  93.75 
 
 		 1017 bp  48.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.861389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1656  ABC transporter related  93.75 
 
 		 1842 bp  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.211709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  93.75 
 
 		 1170 bp  48.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0475544 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  86.54 
 
 		 2010 bp  48.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0185  ABC transporter related  93.75 
 
 		 807 bp  48.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0484  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.43 
 
 		 1164 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1014 bp  48.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0314  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  91.67 
 
 		 1113 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0935  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.43 
 
 		 963 bp  48.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1139  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  93.75 
 
 		 1056 bp  48.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3800  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.75 
 
 		 1041 bp  48.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2815  dipeptide transporter ATP-binding subunit  88.64 
 
 		 1020 bp  48.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.717135  normal  0.0541918 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1950  dipeptide transporter ATP-binding subunit  93.75 
 
 		 1005 bp  48.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.189819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5118  putative ABC transporter ATP-binding  93.75 
 
 		 978 bp  48.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583435  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  96.43 
 
 		 1596 bp  48.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  91.43 
 
 		 1077 bp  46.1  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  88.37 
 
 		 1782 bp  46.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1083  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.55 
 
 		 1167 bp  46.1  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  88.37 
 
 		 1806 bp  46.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4590  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  89.74 
 
 		 1878 bp  46.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0191447  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  93.55 
 
 		 1797 bp  46.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2360  dipeptide transporter ATP-binding subunit  87.23 
 
 		 1035 bp  46.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0981  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  93.55 
 
 		 987 bp  46.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1149  ABC transporter related  93.55 
 
 		 1641 bp  46.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3564  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  100 
 
 		 1926 bp  46.1  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1344  ABC transporter related  100 
 
 		 1437 bp  46.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.37 
 
 		 1896 bp  46.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0137  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  96.3 
 
 		 1020 bp  46.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5689  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  88.37 
 
 		 2091 bp  46.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.34468  normal  0.261455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  93.55 
 
 		 1809 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4330  putative ABC transporter, ATP-binding protein  89.74 
 
 		 1623 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  91.43 
 
 		 1053 bp  46.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  91.43 
 
 		 837 bp  46.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  93.55 
 
 		 1899 bp  46.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3178  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 2184 bp  46.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0486  dipeptide transporter ATP-binding subunit  89.74 
 
 		 990 bp  46.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0426  dipeptide transporter ATP-binding subunit  84.75 
 
 		 954 bp  46.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.153009 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>