74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2462 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2462    100 
 
 		 633 bp  1255    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 1605 bp  377  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1225    100 
 
 		 1869 bp  377  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  85.19 
 
 		 729 bp  349  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  100 
 
 		 360 bp  212  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  89.42 
 
 		 360 bp  119  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  86.96 
 
 		 720 bp  109  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  91.03 
 
 		 360 bp  99.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  87.13 
 
 		 360 bp  97.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  87.13 
 
 		 360 bp  97.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  87.13 
 
 		 360 bp  97.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5306  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  100 
 
 		 1125 bp  95.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  87.5 
 
 		 360 bp  95.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  89.74 
 
 		 360 bp  91.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  90.54 
 
 		 360 bp  91.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  85.19 
 
 		 720 bp  87.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4565    100 
 
 		 357 bp  85.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  89.33 
 
 		 357 bp  85.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1018    100 
 
 		 186 bp  83.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.891485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2353  hypothetical protein  88.46 
 
 		 159 bp  83.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4766  hypothetical protein  100 
 
 		 309 bp  83.8  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0035    83.5 
 
 		 2622 bp  69.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  86.49 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  86.49 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  86.49 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1223    93.48 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  83.17 
 
 		 360 bp  65.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09740    85.71 
 
 		 126 bp  65.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  85.92 
 
 		 357 bp  61.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>