More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0638 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  100 
 
 		 119 aa  239  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  100 
 
 		 119 aa  239  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  100 
 
 		 118 aa  239  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  99.15 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  94.92 
 
 		 119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  94.92 
 
 		 119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  94.92 
 
 		 119 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  94.92 
 
 		 119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  92.37 
 
 		 119 aa  227  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  91.53 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  92.37 
 
 		 119 aa  226  9e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  92.37 
 
 		 118 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  90.68 
 
 		 119 aa  224  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  89.83 
 
 		 119 aa  222  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  89.83 
 
 		 119 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  83.9 
 
 		 119 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  53.1 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  54.87 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  53.1 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  49.11 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  48.21 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  48.21 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  48.21 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  44.34 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0433  IS66 Orf2 family protein  64.29 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03356  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01486  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02643  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08237  transposase  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05907  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02402  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02409  hypothetical protein  45.63 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05210  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02141  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06879  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05512  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02084  hypothetical protein  45.63 
 
 		 220 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02095  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08179  transposase  45.63 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000803759  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02957  hypothetical protein  45.63 
 
 		 220 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01784  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01647  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01942  hypothetical protein  45.63 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>