More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0433 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0433  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 112 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  72.22 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  65.88 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  64.71 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  64.71 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  64.71 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  64.71 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  64.71 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  64.71 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  64.29 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  64.71 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  62.79 
 
 		 119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  63.53 
 
 		 119 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  62.35 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  63.53 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  62.35 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 119 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  48.81 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  55.13 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  55.13 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  48.68 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  43.42 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0366  IS66 Orf2 family protein  44.83 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0282  IS66 Orf2 family protein  44.83 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0274  IS66 Orf2 family protein  44.83 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1987  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.333051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02084  hypothetical protein  46.38 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0832  transposase  42.05 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0070  transposase  42.05 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02957  hypothetical protein  46.38 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01486  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01466  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08237  transposase  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.143502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00180  transposase  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08179  transposase  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000803759  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08159  transposase  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01145  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01460  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02095  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01489  hypothetical protein  46.38 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>