78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1223 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1223    100 
 
 		 360 bp  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  91.94 
 
 		 360 bp  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  91.11 
 
 		 360 bp  460  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  90.83 
 
 		 360 bp  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  85.56 
 
 		 360 bp  301  7e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  84.17 
 
 		 360 bp  262  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  84.03 
 
 		 357 bp  256  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  82.5 
 
 		 360 bp  214  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4024  ISPpu15, transposase Orf1  82.5 
 
 		 360 bp  214  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4746  ISPpu15, transposase Orf1  82.5 
 
 		 360 bp  214  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237213  hitchhiker  0.00598582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  82.5 
 
 		 360 bp  214  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  82.5 
 
 		 360 bp  214  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0638  ISPpu15, transposase Orf1  82.35 
 
 		 357 bp  208  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4092  ISPpu15, transposase Orf1  81.94 
 
 		 360 bp  198  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.0299254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  80.83 
 
 		 360 bp  167  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2353  hypothetical protein  94.12 
 
 		 159 bp  103  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0161  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0106398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2462    93.48 
 
 		 633 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1225    93.48 
 
 		 1869 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  93.48 
 
 		 1605 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4115  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3637  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3085  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.325367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1989  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.215318  normal  0.228694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1549  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.555012  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1164  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0832363  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1049  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0743171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0435  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.566567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0432  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0037  IS66 Orf2 family protein  78.9 
 
 		 360 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0035    78.9 
 
 		 2622 bp  67.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0655  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 303 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0132149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  85.96 
 
 		 360 bp  50.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1987  IS66 Orf2 family protein  88.64 
 
 		 261 bp  48.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.333051  normal  1 
 
 
-
 
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