52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_09740    100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4793  IS66 Orf2 family protein  87.01 
 
 		 360 bp  73.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1718  IS66 Orf2 family protein  87.01 
 
 		 360 bp  73.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0521  IS66 Orf2 family protein  87.01 
 
 		 360 bp  73.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2392  ISPsy5, Orf1  87.01 
 
 		 360 bp  73.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00116713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3966  ISPsy5, Orf1  84.21 
 
 		 360 bp  69.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20530  hypothetical protein  100 
 
 		 255 bp  67.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5305  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3998  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00172729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1016  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1605 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4390  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4566  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4694  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4738  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0621301  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4765  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4995  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5213  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5214  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4252  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5367  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.450388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5412  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.894139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5444  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5544  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5590  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0197  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0040  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0036  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3113  ISPpu13, transposase Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0669  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1017  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1019  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1099  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.438666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1190  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1225    85.71 
 
 		 1869 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1226  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0842  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2436  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2461  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0245256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2462    85.71 
 
 		 633 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2839  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00396597  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2885  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2970  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0658075  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3212  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.071716  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3215  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3612  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.965864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3652  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.219875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3997  ISPsy5, Orf1  85.71 
 
 		 360 bp  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3986  ISPpu13, transposase Orf1  86.76 
 
 		 357 bp  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5371  ISPsy5, Orf1  85.14 
 
 		 360 bp  60  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.018412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2353  hypothetical protein  83.12 
 
 		 159 bp  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3221  ISPsy5, Orf1  87.23 
 
 		 360 bp  46.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0651987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1223    86.96 
 
 		 360 bp  44.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>