20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2228 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  68.24 
 
 		 239 aa  353  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  67.23 
 
 		 239 aa  335  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  58.19 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  56.9 
 
 		 240 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  38.4 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  34.63 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  31.76 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.62 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  30.09 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.64 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.14 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.69 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.87 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.13 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  25.3 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  28.12 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2456  hypothetical protein  56.76 
 
 		 38 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0660195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.629481  normal  0.656138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>