27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3326 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  96.25 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  63.4 
 
 		 239 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  62.34 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  58.19 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  33.48 
 
 		 252 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  29.83 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  30.8 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.5 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.5 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  27.4 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  35.56 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  25.52 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  25.45 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  23.97 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09590  hypothetical protein  30.22 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12380  hypothetical protein  26.49 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0120  hypothetical protein  28.16 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000067409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>