29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1189 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  90.12 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  90.12 
 
 		 243 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  95.47 
 
 		 243 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  86.42 
 
 		 291 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  86.42 
 
 		 243 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  47.28 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  46.58 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  33.76 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  34.45 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  29.73 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  30.87 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  28.28 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  28.05 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  27.52 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  29.3 
 
 		 240 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2031  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  29.71 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  28.71 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1246  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  33.33 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.187515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1679  hypothetical protein  29.09 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.234807  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  28.93 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  29.23 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1016  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.165771  hitchhiker  0.000595947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1077  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1190  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1012  hypothetical protein  29.09 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.066733  normal  0.0704648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0059  hypothetical protein  22.71 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3431  hypothetical protein  22.79 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.93052  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3295  hypothetical protein  22.79 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.021334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>